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疏水區(qū)（蛋白質(zhì)多肽鏈上的氨基酸序列區(qū)段）

次瀏覽 | 更新時(shí)間：2023-05-19

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疏水區(qū)

蛋白質(zhì)多肽鏈上的氨基酸序列區(qū)段

蛋白質(zhì)多肽鏈的疏水區(qū)一般由疏水性氨基酸組成，如纈氨酸、亮氨酸等。這些疏水氨基酸組成的疏水區(qū)段會(huì)由于疏水作用而埋入多肽鏈的內(nèi)部，而親水區(qū)段多分布在多肽鏈的外側(cè)。此外，跨膜蛋白的疏水區(qū)往往也是其跨膜區(qū)。可以通過(guò)疏水區(qū)的分析，實(shí)現(xiàn)蛋白跨膜區(qū)的預(yù)測(cè)。

基本信息

中文名	疏水區(qū)
外文名	Hydrophobic

定義

蛋白質(zhì)多肽鏈上一段由大量疏水性氨基酸組成的氨基酸序列（如纈氨酸、亮氨酸等），該區(qū)段被稱為疏水區(qū)。疏水性是指一個(gè)分子（疏水物）與水互相排斥的物理性質(zhì)。由于氨基酸側(cè)鏈的非極性，沒(méi)有可以解離的基團(tuán)，與水互斥而疏水。

性質(zhì)

疏水鍵

疏水鍵不是真正的化學(xué)鍵，但它能形成疏水性內(nèi)核穩(wěn)定蛋白質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)。蛋白質(zhì)分子中氨基酸的疏水側(cè)鏈由于疏水效應(yīng)而被水驅(qū)入蛋白質(zhì)分子內(nèi)部聚集成簇，帶動(dòng)肽鏈盤曲折疊，對(duì)蛋白質(zhì)三、四級(jí)結(jié)構(gòu)的形成和穩(wěn)定起重要作用。

跨膜區(qū)

跨膜蛋白多肽鏈上的疏水區(qū)可以形成跨膜區(qū)。細(xì)胞膜是磷脂雙分子層，兩層磷脂分子的親水端朝向外側(cè)，與細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞外液接觸，疏水端尾則朝向內(nèi)側(cè)。跨膜蛋白質(zhì)通過(guò)其疏水區(qū)而鑲嵌于細(xì)胞膜磷脂雙分子層的疏水內(nèi)部，實(shí)現(xiàn)跨膜。

應(yīng)用

蛋白質(zhì)跨膜區(qū)預(yù)測(cè)：通過(guò)分析氨基酸序列的親/疏水性，從而預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的跨膜區(qū)，對(duì)預(yù)測(cè)蛋白是否為膜蛋白有重要意義，并據(jù)此開(kāi)發(fā)了很多生物信息學(xué)軟件。

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